巴楚縣中醫醫院，原名巴楚縣維吾爾醫醫院，成立于1984年10月，于2018年2月更為現名。是一所以中醫、維醫與西醫相結合集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的綜合性二級甲等中醫醫院。巴楚縣中醫醫院是上海市靜安區中醫醫院對口幫扶、友好合作單位，每年有上海市靜安區中醫醫院3名**駐院開展援助工作。巴楚縣中醫醫院是烏蘇市中醫醫院友好醫院暨人才結對合作單位，是上海市第三康復醫院“康復健康共同體”，醫院康復科是上海市第三康復醫院“上海市醫學重點學科（合作單位）”，是上海市肺科醫院、上海市中醫醫院外科聯合**黨支部黨建共建合作單位，是愛醫職業工程管理委員會醫學科研共建單位，是中華中醫藥學會眼科協同創新共同體成員單位（巴楚縣中醫醫院）。是新疆維吾爾自治區維吾爾醫醫院、喀什地區**人民醫院、喀什地區第二人民醫院、喀什地區維吾爾醫醫院醫聯體單位。醫院占地面積85畝（56695平方米），業務用房30000平方米，編制床位180張，實開床位470張。醫院現有職工409人，其中正式職工177人，聘用職工232人，正高職稱2人，副高職稱11人，中級職稱45人。醫院共設33個科室，包括臨床科室：中醫心腦血管病科、中醫消化內分泌科、中醫皮膚科、中醫骨傷科、中醫呼吸科、中醫婦科、中醫康復科、中醫康復中心、中醫治未病科，西醫急診科、西醫內科、西醫外科、西醫產科、西醫手麻科，以及中醫科（老年病科）、發熱門診，所有科室均設普通門診、**門診，另有口腔科門診、五官科門診；醫技科室：檢驗科、功能科（含心電圖、B超室）、放射科、器械科、藥劑科（含煎藥室、門診藥房、住院藥房、急診藥房）；職能科室：黨政辦、醫務科（科教科）、護理部、財務科、醫保辦、信息科、質控辦、院感科、公共衛生科、項目辦、總務科。醫院現有全國基層名老中醫藥**傳承工作室1個；康復科、康復中心、皮膚科、心內科、內分泌科、婦科、骨傷科、中醫科（老年病科）、治未病科、煎藥室等10個特色科室，其中，心腦血管專病專科、康復科、婦科為***重點專科培育項目、皮膚科、骨傷科為自治區重點?？疲谎ㄎ毁N敷、熱鹽包、推拿、針灸、拔罐、艾灸、蠟療、鹽堿床、中藥熏洗、藥浴、伏九貼敷、孜瑪得療法等20余項特色中醫、維醫診療項目；各種經典方劑30余種，院內制劑6大類約110個品種，中醫適宜技術25種。醫院配備逾40臺件診療設備，如CT、鉬靶、DR、數字胃腸機、X光機、C型臂、自動血液細胞分析儀BC6800PLs、全自動生化分析儀Bs2000、全自動血凝儀Cs-200、全自動發光儀CL-12001、幽門螺旋桿菌檢測儀YH04E、過敏試驗檢測儀BLOtray866、液基細胞的自動涂片機TKY-B6C、干式熒光免疫分析儀AFS2000A、尿沉查檢測儀US-1680、全自動大便檢測儀RUNWU-S580、全自動電解質分析儀、彩色多普勒超聲診斷儀、12導聯心電圖、動態心電圖、動態血壓監測儀、乳腺掃描儀、骨質增生治療儀、光電離子治療儀、電腦中頻藥物導入治療儀、電腦中頻治療儀、短波治療儀、極超短波治療機、多體位醫用診療床、肌電生物反饋刺激儀、減重步態康復平臺、電腦恒溫電蠟療儀、電腦中頻治療儀、經皮神經電刺激儀、神經肌肉低頻電刺激儀、多關節主被動訓練儀、經顱磁腦病生理治療儀、空氣波壓力治療儀、電針治療儀、遠紅外理療床、超聲波治療儀、頸腰椎治療多功能牽引床、智能疼痛治療儀等。作為全縣中醫藥、維吾爾醫藥發展的領頭羊單位，醫院積極帶領縣鄉兩級醫療衛生機構，共同推動中醫藥、維吾爾醫藥的推廣、傳承、發展，促進優質中醫醫療資源下沉和中醫藥在鄉鎮的傳播與傳承。隨著中醫藥復興進程加快，醫院緊抓中醫藥復興的時代機遇，錨定建設喀什地區區域中醫醫療中心的目標，在上海援疆的支持下，醫院新建了上海中醫藥大學針灸推拿學院新疆巴楚中醫藥特色診療技術交流合作中心暨健康服務人才培訓基地，巴楚縣中醫醫院康復中心、巴楚縣藥食同源研究中心、巴楚縣中醫醫院制劑中心、巴楚縣中醫醫院智慧健康驛站、名中醫岐黃學者亢澤峰眼科工作室（巴楚縣中醫醫院）、上海市中醫醫院針推康臨床醫學中心上海市非物質文化遺產內功推拿流派兒推工作站（巴楚縣中醫醫院），以及正在規劃建設集急診、康復等功能于一體的巴楚縣中醫醫院綜合樓，積極探索、推動中醫藥創新發展，促進醫院更高質量發展。